5. Article

Molekulāri bioloģiskie izmeklējumi Nr. p.k. Manipulācijas nosaukums 5.1. Herpes simplex vīrusu 1 un 2 tipu DNS (PCR), kvalitatīvi 5.2. Epšteina-Barra vīrusa DNS ( PCR) kvalitatīvi 5.3. Chlamydia trachomatis rRNS un Neisseria gonorrhoeae rRNS ar izotermiskās amplifikācijas metodi 5.4. Chlamydia trachomatis rRNS ar izotermiskās amplifikācijas metodi 5.5. Neisseria gonorrhoeae rRNS ar izotermiskās amplifikācijas metodi 5.6. Chlamydia trachomatis, Ureaplasma un Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (RT-PCR) 5.7. Trichomona vaginalis DNS ar polimerāzes ķēdes reakciju ar fluorescences detekciju pēc beigu punkta (end point) 5.8. HIV-1 jutības noteikšana pret CCR5 receptoru antagonistiem, izmantojot genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.9. HIV-1 rezistences pret antiretrovirāliem medikamentiem noteikšana, izmantojot genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.10. T-limfocītu imunofenotipu CD4 (absolūtais skaits, %) un CD8 (absolūtais skaits) 5.11. Cilvēka leikocitārā antigēna HLA B*5701 noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PCR) 5.12. Toxoplasma gondii DNS noteikšana ar RT-PCR 5.13. Pneumocystis jirovecii (carinii) DNS noteikšana ar RT-PCR 5.14. Mycobacterium tuberculosis kompleksa DNS un rezistences pret rifampicīnu noteikšana ar RT-PCR 5.15. Bakteriālo meningītu izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalacticae) DNS noteikšana ar Multiplex PCR 5.16. Bakteriālo pneimoniju izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis, Mycoplasma pneumoniae) DNS noteikšana ar Multiplex PCR 5.17. Legionella pneumophila DNS noteikšana ar RT-PCR 5.18. Mycoplasma pneumoniae/Chlamydophila pneumoniae DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PCR) 5.19. Bordetella pertussis DNS noteikšana ar RT-PCR 5.20. Bordetella parapertussis DNS noteikšana ar RT-PCR 5.21. Meticilīnrezistentā Staphylococcus aureus (MRSA)/Staphylococcus aureus DNS noteikšana ar RT-PCR 5.22. Meticilīnrezistentā Staphylococcus aureus (MRSA) Staphylococcus aureus DNS noteikšana ar PCR 5.23. Bakteriālo diareju izraisītāju (Clostridium perfringens, Yersinia enterocolitica, Aeromonas spp., E.coli 0157:H7, E.Coli VTEC) DNS noteikšana ar Multiplex PCR 5.24. Enterohemorāģisko Escherichia coli (EHEC) DNS noteikšana ar RT-PCR 5.25. Leptospira spp 16S RNS noteikšana ar RT-PCR 5.26. Brucella spp DNS noteikšana ar RT-PCR 5.27. Borrelia DNS noteikšana ar RT-PCR 5.28. Ērču encefalīta vīrusa (TBE) RNS noteikšana ar RT-PCR ērcēs 5.29. Ērču encefalīta vīrusa (TBE) RNS noteikšana ar RT-PCR 5.30. Borrelia DNS noteikšana ar molekulāro hibridizāciju ērcēs 5.31. Babesia DNS noteikšana ar molekulāro hibridizāciju ērcēs 5.32. Salmonella spp genotipēšana ar gēla elektroforēzes pulsējošā lauka metodi (Pulse Field Gel Electrophoresis-PFGE) 5.33. Listeria monocytogenes genotipēšana ar Pulse Field Gel Electrophoresis-PFGE 5.34. Streptococcus pneumoniae serotipu noteikšana ar Multiplex PCR 5.35. Neisseria meningitidis serogrupas (sia D gēni B, C, Y, W 135; mynB gens; porA, fet A gēni) noteikšana ar PCR 5.36. Haemophilus influenzae serotipa (ompP2, bexA, cap a-f gēni ) noteikšana ar PCR 5.37. Neisseria meningitidis porA un fetA gēnu noteikšana ar genotipēšanu, MLST (Multilocus Sequencing Typinky) 5.38. Verotoksīnproducējošo Escherichia coli (VTEC) vtx1 un vtx2 gēnu noteikšana ar PCR 5.39. Mycobacterium tuberculosis DNS tipēšana ar spoligotipēšanu 5.40. Mycobacterium tuberculosis DNS tipēšana ar RLFP (Restriction Fragment Length Polymorphism) 5.41. Mycobacterium tuberculosis DNS tipēšana ar MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number Tandem Repeat) 5.42. Legionella pneumophila tipēšana ar MLST 5.43. Anaplasma phagocytophilium DNS ērcē noteikšana ar RT-PCR 5.44. Mycobacterium leprae DNS noteikšana ar RT-PCR 5.45. Mycoplasma spp DNS noteikšana ar PCR 5.46. B tipa gripas vīrusu līnijas noteikšana ar PCR 5.47. Parainfluenza virus 1-3, Adenovirus A/B/C/D/E, Coronavirus 229E/NL63, Coronavirus OC43, Rhinovirus A/B/C, Influenza A virus, Respiratory syncytial virus A, Respiratory syncytial virus Bocavirus 1/2/3/4, Influenza B virus, Metapneumovirus, Parainfluenza virus 4, Enterovirus RNS/DNS noteikšana ar Multiplex PCR 5.48. Gripas vīrusu mutāciju, asociēto ar rezistenci pret zālēm, noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.49. Gripas vīrusu mutāciju, asociēto ar rezistenci pret zālēm, noteikšana ar RT-PCR 5.50. Masalu (Rubeola) vīrusa RNS noteikšana ar RT-PCR 5.51. Masaliņu (Rubella) vīrusa RNS noteikšana ar RT-PCR 5.52. Masalu (Rubeola) vīrusa genotipa noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.53. Masaliņu (Rubella) vīrusa genotipa noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.54. Epidēmiskā parotīta vīrusa (Mumps) RNS noteikšana ar RT-PCR 5.55. Epidēmiskā parotīta vīrusa (Mumps) genotipa noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.56. A hepatīta vīrusa (HAV) RNS noteikšana ar RT-PCR 5.57. A hepatīta vīrusa genotipa noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.58. C hepatīta vīrusa genotipa noteikšana ar genotipēšanu (sekvenēšanu) 5.59. E hepatīta vīrusa (HEV) RNS noteikšana ar RT-PCR 5.60. B hepatīta rezistence pret lamivudīnu noteikšana ar PCR 5.61. G hepatīta vīrusa (HGV) RNS noteikšana ar RT-PCR 5.62. HSV 1 DNS, HSV 2 DNS, VZV DNS , EBV DNS , CMV DNS, HHV6 DNS, enterovīrusu RNS noteikšana ar Multiplex PCR 5.63. Enterovīrusu RNS (PCR), kvalitatīvi 5.64.